Unter den Singhalesen als Nagadipa (Schlangeninsel) bekannt, ist Nainativu einer der bedeutendsten buddhistischen Pilgerorte des Nordens, denn der Legende nach soll der Erleuchtete höchstpersönlich auf die Insel gekommen sein, um einen Streit zwischen einem Schlangenkönig und seinem Neffen zu schlichten. Heute erinnert ein stets geschmückter Stupa an diesen Besuch.